Wako Phos-tag-用于磷酸化蛋白分析使用問題與解答
1.???? Phos-tag? Acrylamide的溶解
5mmmol/ Phos-tag? 液體 (3v/v% 甲醇):
1)??? 10mg? Phos-tag? Acrylamide 里加入 0.1mL 甲醇
2)??? 使用槍頭攪拌混合直至完全溶解。
3)??? ?加3.2mL 蒸餾水, 用槍頭混勻。
2-8℃避光保存。不適合零度以下保存。建議保存時間6個月。
?注意:避免溶解過程出現白色懸浮顆粒。
2.???? α-Casein, from Bovine Milk, Dephosphorylated(038-23221),陽性對照(含有磷酸化和非磷酸化
?α-Casein),如何使用?
?用水或者上樣buffer溶解。用水溶解后,冷凍保存。電泳條件:Phos-tag? 50umol/L,分離膠濃度 10%。
?電流:30mM,1小時。
?
3.???? 用Alkaline Phosphatase(for Biochemistry)(018-10693)進行磷酸化蛋白的去磷酸化反應體系。
37℃,過夜。# 10 mg/mL phosphorylated protein 50 μL
# 0.50 M Tris/HCl buffer (pH 9.0) containing 0.10 M MgCl2 10 μL
# Sterilized water 39 μL
# Alkaline phosphatase(018-10693). 0.3 unit / 1 μL有一點需要注意:ALP活性化使用Mg離子,相
?同的非磷酸化蛋白質用ALP處理的樣品的條帶和沒有用ALP處理的樣品的條帶的位置不同。
?
4.???? Phos-tag? SDS-PAGE實驗沒有成功分離磷酸化蛋白:
1) 使用α-Casein, from Bovine Milk, Dephosphorylated(038-23221)作為陽性對照,確認實驗條
件和試劑均沒有問題。
2) 可使用Phos-tag?Biotin檢測樣品中是否有磷酸化蛋白。確認有磷酸化蛋白后,再通過
Phos-tag ?SDS-PAGE進行分離鑒定。
3) 經質譜鑒定有表達磷酸化蛋白,建議增大樣品的含量,可使用Phos-tag ?Agarose進行磷酸化蛋白
的富集。磷酸化蛋白含量過低,會影響其分離效果。
4) 文獻報道有表達磷酸化蛋白,或者同源蛋白有表達磷酸化蛋白的,建議用Phos-tag? Biotin先確認
樣品中是否有磷酸化蛋白。
5) 建議樣品的pH值在7左右。酸性或者堿性條件下,Mn2+-Phos-tag?與磷酸化基團的特異性結合較
差。
6) 避免樣品中含有高濃度的還原劑,變性劑,表面活性劑等。β-巰基乙醇濃度不高于0.2M(或者5%)。
7) 進行Phos-tag? SDS-PAGE的佳樣品是純化的蛋白。如果是細胞裂解液,體外激酶反應液,組織均
漿液等,需要摸索佳的分離膠,Phos-tag? Acylamide的濃度。建議Phos-tag? Acrylamide濃度
從50uM開始摸索。
?
5.???? Phos-tag?SDS-PAGE凝膠用于Western Blotting實驗的優化建議:
1) 可以檢測的樣品包括體外激酶反應體系,細胞裂解液,組織均漿液。
2) 每孔樣品的上樣量是10~30ug(請根據蛋白表達量進行調整)
3) 制備樣品中含有的還原劑、變性劑、螯合劑、釩酸等會使電泳條帶發生彎曲或者拖尾。通過TCA沉淀或
滲析法降低雜質含量。
4) 建議樣品的pH值在7左右。如果加入上樣緩沖液后溶液顯黃色或者橙色,加入Tris緩沖液調整pH值為7。
5) 目的蛋白分子量大于60kDa,分離膠的丙烯酰胺濃度為6%;目的蛋白分子量小于60kDa,分離膠的丙烯
酰胺濃度為8%。
6) 如果樣品中含有大量蛋白,比如細胞裂解液,組織均漿液,Phos-tag? Acylamide濃度為5~25uM。
若目的蛋白濃度低,建議Phos-tag? Acylamide濃度為100uM。
7) Phos-tag ?SDS-PAGE凝膠用于Western Blotting實驗,濕法轉膜建議:10mM EDTA的轉移緩沖液
處理凝膠10min,不含有EDTA的轉移緩沖液處理凝膠10min。重復3次。強烈建議濕法轉膜
8) Phos-tag? SDS PAGE半干法轉膜建議:
????????????? i.????? 電泳后用含有EDTA的轉移緩沖液處理凝膠,EDTA的濃度為 100mM。100mM EDTA的轉移
緩沖液處理凝膠10min,不含有EDTA的轉移緩沖液處理凝膠10min。重復3次。
???????????? ii.????? 轉膜的電流值提高2%~3%, 延長時間2成。
??????????? iii.????? 轉膜的緩沖液加SDS,加到大約0.05~0.2%,轉膜效率會提高。
9) 使用目的蛋白的非磷酸化抗體即可。比如檢測各種腫瘤細胞系中Src激酶活性實驗,用Src的非磷酸化抗
體即可。
10) 和光的WIDE-VIEWTM Prestained Protein Siza MarkerIII(230-02461)可檢測作為轉膜效率,但是無
法判斷分子量。
11) 一般預染的蛋白marker在Phos-tag?SDS-PAGE中條帶會彎曲,無法判斷蛋白分子量。
12) 不能確認磷酸化蛋白和非磷酸化蛋白的分離,請進行常規的SDS-PAGE,Western Blotting實驗。比
對目的蛋白的遷移率。
13) 不能確認是因為蛋白發生磷酸化還是出現降解造成蛋白條帶遷移,請進行常規的SDS-PAGE實驗,確
認不會出現條帶遷移。
14) 目的蛋白磷酸化與非磷酸化分離效果不佳,使用α-Casein, from Bovine Milk, Dephosphorylated
(038-23221)作為陽性對照,確認實驗條件和試劑均沒有問題。如果確認能夠分離,調整分離膠,
Phos-tag? Acylamide的濃度。建議使用品質佳的MnCl2(139-00722)。
產品編號 | 產品名稱 | 產品規格 | 產品等級 |
304-93526 | ?Phos-tag?Acrylamide?AAL-107 5mM?Aqueous?Solution?Phos-tag?丙烯酰胺5mM水溶液 |
0.3mL | 蛋白研究 |
300-93523 | ?Phos-tag?Acrylamide?AAL-107 Phos-tag?丙烯酰胺 |
2mg | 蛋白研究 |
304-93521 | ?Phos-tag?Acrylamide?AAL-107 Phos-tag?丙烯酰胺 |
10mg | 蛋白研究 |
134-15302 | Manganese(II)?Chloride?Tetrahydrate氯化錳四水合物 | 25g | for?Molecular?Biology |